營所稅申報最後流程是上傳資料，如果都填好了，申報書表也已經匯出為媒體申報檔案的話，只要依照系統的流程提示操作即可，本文具體介紹相關流程。
一、營所稅審核申報
營所稅所有應該填寫的資料都輸入完畢之後，可以在系統的主畫面右下方點選「審核申報」。
二、結算審核申報
「審核申報作業」分成結算與決算兩大塊，通常正常的年度申報都是屬於左邊的「結算審核與申報作業」。至於決算作業顧名思義，是屬於公司有重大變更或者結束營業時必須總結計算營業所得的意思。
三、會計期間曆年制
接下來同樣有兩個選項：「曆年制」與「特殊會計年度制」。依照贊贊小屋在事務所接觸過大大小小不同公司的經驗，大部分臺灣公司少有例外都是普通的曆年制，會計期間從年初1月1號到年底12月31號。採取特殊會計年度制幾乎是外商，例如日本或者歐洲美國總公司的子公司，他們的財務報表本來就習慣可能是從年度中間的某個月份開始，因此報稅也會選擇特殊期間。
四、前端審核上傳
正式進入「審核申報系統」，在此首先選擇左側第一階段「網路申報」中的「前端審核與申報上傳」。
五、登記地稽徵機關
接著出現一個視窗提醒，應該是要向登記地的稽徵機關辦理申報，這個可能是第一次申報的時候要特別注意，如果以後年度申報而且登記事項沒有變更的話，通常保留原始的跟上個年度相同即可。
六、選擇申報檔案
在熟悉的windows檔案總管視窗中選擇先前系統操作步驟已經導出的申報檔案，這裡預設的是報稅軟體資料夾，因此如果沒有特殊的需求的話，在導出時候使用預設資料夾路徑就好了，後續系統作業都會比較方便一點。
營所稅媒申檔案匯出作業，可以參考贊贊小屋相關文章。
七、系統開始審核
在接下來的申報資料上傳視窗中，先前步驟有提到是以登記地的稽徵機關為主，因此這裡的「國稅局」和「稽徵機關」是選擇本次申報的營利事業登記地，接著在「申報類別」的部分，一般中小型企業可以選擇「7.擴大書審案件」，最後就可以按下「開始審核」。
對於是否適用擴大書審想要進一步瞭解，可以參考贊贊小屋相關文章。
八、審核資料無誤
沒有異常的話系統會提示媒申檔案審核資料無誤，注意到這裡有個提醒，通常營利事業是公司組織，一個獨立的法律個體，進行營所稅申報很正常。如果是獨資合夥的話，其實並沒有一個獨立的法律個體，並不是法人，而是依附在資本主或者是合夥人裡面的經濟組織，像這樣子的企業雖然在稅務上也屬於營所稅主體，要申報營所稅，可是在真正繳納所得稅的時候，仍然要回歸到資本主或者合夥人的綜合所得稅，作為營利所得進行個人綜合所得稅的申報計算與繳納。
九、出資轉讓檢查
接下來系統提示有些特殊情況是須填報「第C4頁公司股東(獨資資本、合夥人)股份(股票、出資額)轉讓通報表」，在此系統文字說明蠻詳細的，請依照實際的狀況選擇確定或者取消。
十、申報資料上傳
回到申報資料上傳的視窗，由於先前步驟已經審核過媒申檔案，沒有問題了，在這裡可以直接點選營所稅申報資料上傳。
十一、選擇憑證種類
經過前面步驟的作業準備，到這裡終於要真正開始上傳營所稅申報資料了，在此須進行認證，可以依照自己方便選擇帳號密碼或者是工商憑證。
十二、申報上傳成功
帳務較為簡單沒有稅務應處理事項，依照贊贊小屋系列文章和稅局系統提示，經過一連串的操作之後應該會看到這裡的「申報成功」！同樣有一些提示文字，包括列印、收件編號，再次確認狀況等，此外最後還有關於繳納所得稅的補充說明。
營所稅自行申報注意事項
贊贊小屋關於營利事業所得稅申報的系列文章到此大致告一段落，從整個系列文章的流程來看，會計政策完備的企業要進行申報營所稅流程並不會太複雜，不過如同這篇文章最後系統所提示的，自行申報可能有三個需要注意的地方：第一、當然是企業本身的會計政策及帳簿憑證要完備；
第二、如果申報流程有哪個地方出差錯的話，沒有申報上傳成功會有滯納金；第三、也許都有依照系統的必要頁式填寫，但有可能相關的稅務優惠並沒有主動申請，錯過了可以減輕稅負的可能。
以上三點，作為贊贊小屋營所稅申報系列文章最後總結。
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